第10章 首个重要发现的喜悦共享(1/2)
跨实验室合作项目在紧张有序地推进了近一年半之后,终于迎来了决定性的时刻。项目聚焦于解析黑色素瘤免疫治疗耐药机制,已经积累了海量的单细胞RAc-seq(测染色质开放性)数据,以及详细的临床治疗反应信息。顾言澈构建的新一代计算模型,旨在整合这些多组学数据,预测决定治疗响应的关键细胞亚群和分子调控网络。
这是一个周五的深夜,项目进入最关键的攻坚阶段。顾言澈在It的计算机集群上,运行着最终版的整合分析算法。巨大的数据量使得运算异常缓慢,预计需要通宵。苏念晴在harvard的实验室,刚完成一批重要样本的质控,正准备回家。她给顾言澈发了条信息:“模型跑得怎么样?我先回去给你弄点吃的。”
顾言澈回复:“刚开始,估计要到明早。路上小心。”
苏念晴回到公寓,简单准备了夜宵,却毫无睡意。她知道,这次分析的结果至关重要,可能直接揭示耐药的“开关”。她打开电脑,远程登录到实验室的服务器,开始处理另一部分数据,同时也时不时刷新着顾言澈那边的计算状态页面。这是一种无声的陪伴。
凌晨三点,顾言澈的屏幕终端突然快速滚动起来,然后跳出了“calcution Fished”的提示。他深吸一口气,点开了结果汇总文件。屏幕上开始生成一系列复杂的图表:细胞聚类图、基因调控网络图、细胞间通讯图、以及最关键的治疗响应预测与真实临床结果的关联图。
随着图表一帧帧呈现,顾言澈的眼睛越来越亮。数据清晰地显示,在耐药患者的肿瘤微环境中,存在一个之前被忽略的、特定的髓系免疫细胞亚群(我们暂称为“亚群x”)。这个亚群的数量与治疗失败显着相关。更令人兴奋的是,模型预测,这个亚群通过表达某些特定的配体,抑制了杀伤性t细胞的活性,并且其自身的存在和功能,受到一个由几个关键转录因子构成的核心调控模块的控制!
所有的证据链,在计算结果中完美闭合。模型不仅找到了“嫌疑犯”(亚群x),还推测出了它的“作案手法”(抑制t细胞)和“受谁指使”(核心转录模块)。预测的准确性,在与临床数据的对照中得到了惊人的验证。
饶是冷静如顾言澈,此刻心脏也剧烈地跳动起来。他立刻拿起手机,拨通了苏念晴的电话。电话只响了一声就被接起,显然她也在屏幕前守着。
“出结果了!”顾言澈的声音带着一丝难以抑制的激动。
“怎么样?!”苏念晴的声音瞬间紧绷。
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