第4章 科研瓶颈期的相互启迪(2/2)
于是,在空荡的、只剩下保洁阿姨脚步声的图书馆里,他们开始了一场跨学科的“疑难会诊”。顾言澈在白板上画出他模型的框架,解释他如何用神经网络节点模拟生物分子,用边模拟相互作用。
苏念晴听着,敏锐地指出:“你的模型假设相互作用是瞬时、对称的?但生物学里,很多信号是定向、有延迟的,比如配体受体结合后的磷酸化级联反应。而且,微环境中的浓度梯度效应,你的模型似乎没考虑?”
顾言澈一怔,随即恍然:“有道理!这是关键!我可能过度简化了动力学过程。或许需要引入时间卷积或者注意力机制来捕捉时序依赖和方向性。”
轮到苏念晴阐述她的困境时,顾言澈盯着她展示的细胞空间分布散点图,思考良久,说:“你的问题,或许可以看作一个图结构重建问题。但现在的数据太稀疏,直接建图噪声太大。能不能先不考虑具体的相互作用类型,而是先用一种更鲁棒的方法,定义细胞之间的‘空间邻近性’和‘共现模式’?比如,借鉴生态学里的物种共现网络分析方法?先找到稳健的‘社区结构’,再深入分析社区内的互作。”
苏念晴眼睛一亮:“对啊!先不管具体怎么作用,先看谁和谁总是‘呆在一起’!这个思路可以绕过直接建模互作的困难!我可以试试用图论里的社区发现算法!”
这场原本旨在倾诉烦恼的交流,意外地成了突破瓶颈的转折点。来自不同学科的视角,像一束光,照亮了对方思维中的盲区。他们用自己领域的语言和工具,为对方的问题提供了全新的解决路径。
接下来的几周,他们按照讨论的新思路分别进行调整。顾言澈在模型中引入了时序注意力和非对称相互作用边,模型的稳定性和预测准确性果然显着提升。苏念晴采用图社区发现的方法处理空间数据,果然识别出了一些具有显着生物学意义的细胞空间聚集模式,为后续分析打开了新局面。
虽然距离完全解决课题还有很长的路要走,但最令人窒息的僵局被打破了。他们再次感受到了前进的动力。这次科研瓶颈期的相互启迪,让他们更加深刻地认识到彼此的价值。他们不仅是生活中的伴侣,学术上的合作者,更是思维上不可或缺的“异质”催化剂。在探索未知的艰难旅程中,拥有一个能够从完全不同角度提供灵感和支持的同行者,是无比珍贵的幸运。这段共同穿越迷雾的经历,让他们的学术纽带和情感联结,都变得更加坚韧和深厚。