第7章 项目组里的“外援”高手(1/2)
期中考试后,大学学习进入了更注重实践和探索的阶段。苏念晴参加的生物信息学导论课,布置了一个小组项目:利用公共数据库,分析一组癌症基因组测序数据,寻找可能的致病突变基因,并完成一份研究报告。这对大一新生来说,挑战不小。
苏念晴所在的小组共有四人,除了她,还有两名生科院同学和一名计算机系的同学。起初进展顺利,大家分工合作,查阅文献,下载数据。然而,在数据预处理和清洗阶段,他们遇到了难题。原始数据量巨大,格式不统一,存在大量噪音和缺失值。计算机系的那位同学尝试写脚本处理,但效率不高,且常常出错,导致后续分析无法进行。
小组讨论陷入僵局,眼看截止日期临近,组员们都有些焦躁。苏念晴看着混乱的数据和停滞不前的进度,想到了顾言澈。他的编程能力和数据处理能力极强,或许能有办法。
晚自习后,她抱着笔记本电脑,来到137号座位,有些不好意思地向顾言澈说明了小组遇到的困境。“……数据很乱,清洗起来特别麻烦,我们卡了好几天了。你……能帮我们看看吗?”她知道顾言澈自己的学业和机器人社的项目也很忙。
顾言澈接过电脑,快速浏览了一下数据文件和小组同学写的半成品代码,眉头微蹙。确实,代码逻辑不够严谨,处理方式笨拙。“问题不大。”他言简意赅地说,随后打开自己的电脑,新建了一个脚本文件,“我重写一个。”
只见他修长的手指在键盘上飞快敲击,一行行简洁高效的代码流淌而出。他运用了正则表达式、pandas库的数据框操作和异常值处理函数,思路清晰,逻辑严密。苏念晴在一旁专注地看着,虽然有些细节不能完全看懂,但能感受到他那种举重若轻的从容。
不到一小时,一个功能完善的数据清洗脚本就完成了。顾言澈运行了一遍,原本杂乱无章的数据瞬间变得整齐划一,缺失值被合理填充,噪音被有效过滤。
“好了。”他把电脑推回给苏念晴,“注释写好了,应该能看懂。后续可以用这个基础做可视化分析。”
苏念晴又惊又喜,运行了一遍脚本,效果完美!“太厉害了!顾言澈,你真是我们的救命恩人!”她激动地说。
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